<div dir="ltr">Merci Nicolas,<div><br></div><div>Très intéressant.</div><div><br></div><div>On devrait tous recevoir et tenter d'appliquer ces régles des le début d'une thèse.</div><div><br></div><div>Ou d'un projet d'ailleur.</div>

</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/10/30 Nicolas Limare <span dir="ltr"><<a href="mailto:nicolas.limare@cmla.ens-cachan.fr" target="_blank">nicolas.limare@cmla.ens-cachan.fr</a>></span><br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Ten Simple Rules for Reproducible Computational Research<br>
by Geir Kjetil Sandve, Anton Nekrutenko, James Taylor and Eivind Hovig<br>
-> <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285" target="_blank">http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285</a><br>
<br>
The background of this article is biology, but I think the 10 rules<br>
given here make sense for our community too. The rules are:<br>
<br>
Rule  1: For Every Result, Keep Track of How It Was Produced<br>
Rule  2: Avoid Manual Data Manipulation Steps<br>
Rule  3: Archive the Exact Versions of All External Programs Used<br>
Rule  4: Version Control All Custom Scripts<br>
Rule  5: Record All Intermediate Results, When Possible in<br>
         Standardized Formats<br>
Rule  6: For Analyses That Include Randomness, Note Underlying Random<br>
         Seeds<br>
Rule  7: Always Store Raw Data behind Plots<br>
Rule  8: Generate Hierarchical Analysis Output, Allowing Layers of<br>
         Increasing Detail to Be Inspected<br>
Rule  9: Connect Textual Statements to Underlying Results<br>
Rule 10: Provide Public Access to Scripts, Runs, and Results<br>
<br>
They somehow complement the rules implied by IPOL. Rules 1, 2, 4, 5,<br>
6, 7 would also helo IPOL authors when they are asked to correct a<br>
figure or explain an image inserted in an article. Rule 10 is very<br>
close to what IPOL provides.<br>
<br>
All the best,<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Nicolas LIMARE<br>
<a href="http://nicolas.limare.net/" target="_blank">http://nicolas.limare.net/</a>                         pgp:0xFA423F4F<br>
</font></span><br>--<br>
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<br>
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<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><font>Regards/Cordialement,</font></div><div><font>Pierre M</font></div>
</div>